1.物理过滤
滤材为过滤棉（粗/细）利用滤棉中的纤维把水中的不溶性杂质、废物阻隔下来。物理过滤是过滤系统中必不可少的一个部分，滤棉要经常换洗，能有效减少缸中有机物的含量，进而减少矿物质废物的产出。
2.化学过滤
滤材为吸氨石、软水树脂、草泥丸、活性碳。利用吸氨石、软水树脂、草泥丸等，通过化学的方法去除可溶于水的有害物质，或调节PH值（酸碱度）；另外，活性碳运用的过滤中，虽然它起到物理的吸附作用，但针对的仍是溶于水的物质，所以在这里，认为放在化学过滤这个部分更容易理解。
3.生物过滤
滤材为玻璃环、生化球、生化棉等。运用玻璃环、生化球等滤材，提供硝化细菌良好的生长空间，得用硝化细菌的生物作用把鱼类、水草新陈代谢产生的有毒废物转化为无毒物质，这是保持水族箱沾沾自喜稳定的环节。
4.其它作用
比如过滤的水流还能起到冲刷清洁水草叶面、促进鱼儿游动锻炼、防止水体温度分层等。
